Introduktion
Myggor, fästingar och andra leddjur som sprider sjukdomar utgör en global hälsoutmaning och är en bidragande faktor till över 700 000 dödsfall varje år. Klimatförändringar och markanvändning har en betydande inverkan på spridningen av patogener. Urbanisering och internationell resa ökar risken för överföring och (åter)uppkomst av myggburna sjukdomar. I Kanada blir endemiska patogener som West Nile-virus, Eastern equine encephalitis-virus och virus från California serogruppen allt viktigare. Trots denna ökning underskattas fallen av virus från California serogruppen, vilket understryker det brådskande behovet av förbättrad övervakning och testning. Övervakningsinitiativ kan förbättra upptäckt och kontroll, vilket SARS-CoV-2-epidemin visat. Ökningen av fall av virus från California serogruppen och de potentiella hoten förknippade med dessa i Nordamerika har ökat behovet av robusta, känsliga och specifika övervaknings- och testningsmetoder.
Studie
Denna studie presenterar en modern, effektiv och kostnadseffektiv RNA-extraktionsmetod baserad på TRIzol för att upptäcka virus från California serogruppen i poolade myggprover. Denna metod gav en konsekvent RNA-extraktion och känslig virusupptäckt jämfört med två kommersiella extraktionskit (QIAGEN RNeasy Mini Kit och MACHEREY-NAGEL NucleoSpin RNA Plus Kit). Införandet av en användarvänlig och utan spårämnen RT-qPCR för 18S rRNA-genen i myggor minimerar risken för falskt positiva/negativa resultat och förbättrar därmed virusupptäcktens noggrannhet. Den effektiva RNA-extraktionsprestandan, renheten och framgångsrik amplifikation av målmaterialet från genetiskt material hos alla 25 myggarter och olika gruppstorlekar (från 1 till 50 myggor i ett prov) bekräftar metoden tillförlitlighet. Extraktionsmetoden är kostnadseffektiv, med en kostnad på 0,58 CAD per prov jämfört med en kostnad på 5,25 CAD per prov för de två kitens. Detta gör metoden lovande för övervakningsinitiativ av myggburna sjukdomar.
Slutsatser
Denna studie presenterar en modern RNA-extraktionsmetod för att upptäcka virus från California serogruppen i poolade myggprover. Metoden baserad på TRIzol säkerställer effektiv RNA-extraktion och känslig virusupptäckt samtidigt som den är kostnadseffektiv. Den utgör en viktig verktyg för övervakning och kontroll av myggburna sjukdomar som blir allt mer betydelsefulla. Dessutom förbättrar användningen av en RT-qPCR utan spårämnen resultaten noggrannhet och minskar risken för felaktiga tolkningar. Moderna och kostnadseffektiva metoder som denna är avgörande för effektiv övervakning av myggburna sjukdomar, särskilt med tanke på det ökande hotet i Nordamerika.
Vanliga frågor:
1. Vilka sjukdomar sprids av myggor, fästingar och andra leddjur?
Svar: Myggor, fästingar och andra leddjur kan sprida sjukdomar som exempelvis malaria, denguefeber och borrelia.
2. Hur påverkar klimatförändringar och markanvändning spridningen av patogener?
Svar: Klimatförändringar och förändringar i markanvändning kan påverka miljön och habitatet för patogener och vektorer vilket kan öka spridningen av sjukdomar.
3. Hur ökar urbanisering och internationell resa risken för överföring av myggburna sjukdomar?
Svar: Täta befolkningscentra och ökad internationell resa bidrar till ökad exponering för sjukdomsbärande myggor och spridningen av myggburna sjukdomar.
4. Vilka patogener är endemiska i Kanada?
Svar: I Kanada är exempel på endemiska patogener West Nile-virus, Eastern equine encephalitis-virus och virus från California serogruppen.
5. Varför underskattas fallen av virus från California serogruppen?
Svar: Fallen av virus från California serogruppen underskattas troligen på grund av bristande övervakning och testning.
6. Hur kan övervakningsinitiativ förbättra upptäckt och kontroll av myggburna sjukdomar?
Svar: Genom övervakning kan man tidigt upptäcka och följa spridningen av myggburna sjukdomar och vidta åtgärder för att minska risken för smittspridning.
7. Vilka är egenskaperna hos den moderna RNA-extraktionsmetoden baserad på TRIzol?
Svar: Den moderna RNA-extraktionsmetoden baserad på TRIzol är effektiv, pålitlig och kostnadseffektiv för att isolera RNA från myggprover.
8. Vilka RNA-extraktionskit jämfördes med metoden baserad på TRIzol?
Svar: I studien jämfördes metoden baserad på TRIzol med QIAGEN RNeasy Mini Kit och MACHEREY-NAGEL NucleoSpin RNA Plus Kit.
9. Vilka fördelar medför införandet av en användarvänlig RT-qPCR-test för 18S rRNA-genen i myggor?
Svar: Införandet av en användarvänlig RT-qPCR-test för 18S rRNA-genen i myggor minskar risken för felaktiga resultat och förbättrar noggrannheten i upptäckten av virus.
10. Vilka är slutsatserna från studien?
Svar: Studien presenterar en modern RNA-extraktionsmetod baserad på TRIzol för att upptäcka virus från California serogruppen i myggprover. Metoden är effektiv, känslig, kostnadseffektiv och viktig för övervakning och kontroll av myggburna sjukdomar.
The source of the article is from the blog macnifico.pt